進入21世紀，地球的生態環境越來越惡劣，原始叢林不斷消失，眾多物種瀕臨滅絕。在這生死存亡的時刻，“永恒地球”的總裁大山賢造開始實施他的“新森林”計劃，他在海洋中央建造一個相當於北海道大小的人工小島，隨後強制性地將無家可歸的動物移到這片新森林。動物們起初欣喜過望，但不久便發現自己的行動全部受到人類的監視，甚至生命安全也受到威脅。為了生存，獅子王潘加擔負起管理新森林的重任，卻被其他同伴認為是討好人類；而黑豹托托則走向極端，將人類視為襲擊和殺害的目標。大山的兒子賢一偶然走進森林，並和潘加的兒子雷歐成為好朋友。賢一從朋友的口中聽到朋友的怨憤，才明白人類正為自己的一廂情願犯下錯誤。與此同時，傳染病四處蔓延，大山似乎正在醞釀一個恐怖的計劃……
