劇本部分內容根據魏肇權原紀實《大劫獄》改編。
1946年夏天，任國民黨上尉軍官的地下黨員馬雲飛
被任命為國防部特勤小組組長，帶領其他四人將製造南京大屠殺的元兇之一、乙級戰犯石岩夫（原型為穀壽夫）引渡到中國首都南京進行審判。一行人踏上了曲折迂回，危機重重的押送戰犯的歷程：從東京到大連，從天津到武漢，從蕪湖到上海途中，他們遇到明裏暗裏交替出現的兩股敵人--日本軍國主義死硬分子和尚未暴露的軍委會漢奸高官。特勤小組一行人始終以民族大義和國家利益為宗旨，鬥智鬥勇，最終將石岩夫押上法庭；同時揭露了當年出賣三百部下給731細菌部隊當“馬路大”的驚天大案！已經完成任務的馬昀飛脫身在際，卻驚聞石岩夫舊部劫獄。他不顧個人安危，重又返身撲向險叢中。他的壯舉引起了一直監視他的特勤小組副組長孟凡彬少校的敬重。最終在制服了日方殘部之後，孟凡彬追隨馬昀飛一起乘船跨江，奔向了解放區。
馬昀飛是國民政府國防部警衛團參謀，特勤小組組長，但真實身份是中共地下黨員，孟凡彬則是特勤小組副組長，兩人一起負責押送二戰日本戰犯到達審判地點，剛開始的時候，關係非常的密切，但隨著馬雲飛的真實身份被暴露，孟凡彬應上級命令不得不時時提防馬昀飛。
